简曜洋（马国明 饰）、顾家强（陈山聪 饰）、乔宝宝（唐诗咏 饰）、乔带囡（林子善 饰）曾是反恐特勤队的“四剑侠”，一次行动的一个错误决定，令四人各散东西，情谊不再。后来，一宗无差别杀人事件令四人重遇，但当中的怨恨仍纠缠不清。隐形任务战略部队是反恐情报组另一精锐，主管方国希（江美仪 饰）赏识宝宝，招揽麾下；队内仰慕拍档曜洋的杜小婕（刘佩玥 饰）得悉宝宝与曜洋的前恋人关系，从此“开战”。闹市发生连串爆炸案，宝宝调查时向狱中极度重犯匡胜天（陈展鹏 饰）求教，过程意外地顺利，原来胜天潜藏着巨大阴谋……

《谁家的孩子》第二季延续第一季的故事，孩子们都长大了一岁，仍然是一群快乐的小学生。急公好义的夏子鹏，调皮捣蛋的邱阳，聪明伶俐的诗琪，古灵精怪的雪灵，还有品学兼优的表哥璨彬。新的学年，他们身边多了一群新的朋友，机灵鬼文辉，小不点天天，新班长小蔓，开心果安安，他们的学习和生活依然是丰富多彩，他们的家长依然是爱恨交加。他们自我的意识在苏醒，开心和烦恼敲打着他们的心窗，身边的世界开始展示出更多更复杂的层面，他们继续享受着快乐的童年，收获着身心的成长，也经历着磕碰和摔打。

庄子乔和张心月是儿时朋友，因为彼此父亲犯下罪行，他们走上了截然不同的道路。两人久未见面，因为一份一千万的人寿保险而重遇。随之而来的是一宗宗意外和命案，心月周围的人被一一卷入。子乔、心月和多年前的案件，有着怎样的羁绊？他们能否找到内心深处的隐门……

由于邮递员的精心大意，送错了医院的病情会诊报告，年逾古稀的星爷以为自己得了爱滋病，由此产生了轻生的念头。这时，与他失散多年的孪生兄弟亚爷历尽千辛万苦找上门来，亚爷离家多年，终于回来，却因心脏病突发猝死在浴室里，并被误认为星爷，待星爷回来看到家门口摆放着花圈，认为是天意，便要服毒自杀。幸孙子把毒药换掉才避免了悲剧的发生。

本来是重案组沙展的朱华标（刘青云 饰）因殴打上司被处分调往冲锋队。成为麦兜（张达明 饰）、Apple（李绮红 饰）、大丹、胡椒（陈小春 饰）几人的上司，但朱标华却与胡椒常常发生矛盾。 此时，重犯教授与小鸟成功从狱中逃脱，更想在闹市中枪杀一名国际刑警，标华不管上司及同事的反对而奋力追捕，就算最后他们一组人成功将教授抓获。一天他们在巡逻时，标华收到消息这群罪犯要到国际刑警的总部偷取九千万的赃款，标华正欲前往，但他们本身就有任务在身，胡椒便极力反对标华的行动，朱华标会做出怎么样的选择呢？